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的空间转录组测序分享

服务器转录组测序（Spatial Transcriptomics）不是项前沿性技艺，用以在进行至时拿DNA描述新信息和服务器地理分布数据文件报告。就能够从一整片完整详细的进行薄片中拿薄片不一样区域内部中的转录组数据文件报告。服务器转录组在海洋生物临床的研究、患病机理和口服药搭建中还具有诸多的用途未来，助于深入细致认知内部的工作和间接用处。

神经生物学：在周围神经装置中的应用促进企业掌握不一样脑位置的上皮细胞类行、模块和间接的作用；
发育生物学：可追踪定位不相同健康成长的过程中不相同神经元的人类基因表现变现，能够理解神经元分裂和健康成长；
肿瘤生物学：在癌肿微情况中几种体细胞的转录把你想表达出来及免役实用功能的认识因素引领比较重要目的；
免疫学：分析免役抗体检测生殖人体细胞在团体中的规划和技能对于那些理解是什么免役抗体检测响应至关首要，能够分析有差异免役抗体检测生殖人体细胞形式的DNA理解和彼此之间帮助。

10x Visium

10x Genomics Visium将表观遗传范围展现大数据可视化，在快速精确多种人体神经细胞群的一并使用范围背景图片，供给了了并于阻止微生活环境中人体神经细胞技能、表型和位址影响的主要短信，为表观遗传展现和阻止繁杂性学习供给了一个新角度。

将冻冰机构切块储放在10X Genomics Visium集成ic的的截获区域性内，参与HE上色和显像后，对机构切块参与透化治疗，血细胞内的mRNA减少，以此被集成ic上配有oligo-dT的探头截获，还任何探头都配有特异的地此编码序列，以后以mRNA为模板参与cDNA自动合成，勾勒文库后参与测序，以此也能换取染色体表述的地方短信。

Visium发展空间DNA表达出来玻片资讯

Visium电子器件有4个获取行政空间，一个行政空间规格为6.5mm *6.5mm，一个spot直径不低于为55um，分为百余万个应用于获取的oligo电极回文编码回文编码序列，毗邻两spot点的核心时间为100um。电极回文编码回文编码序列的架构为：测序引物运用回文编码回文编码序列，16 nt spatial barcoded，12 nt UMI及30 nt oligo-dT回文编码回文编码序列。

样本起始量与送样建议

组织类型	样本收集
OCT包埋结冰公司/白片/切成片	制备 OCT包埋冰冻组织块，建议组织大小为长×宽不超过 6.5mm×6.5mm，高度≥5mm；白片或贴片建议准备6-13 片（10μm 厚度）。封装好用干冰进行寄送。
FFPE包埋组织化/白片/切成片	石蜡包埋组织封装好后，4℃进行寄送。石蜡包埋白片或贴片建议准备6-13 片（5μm 厚度），4℃进行寄送。

留意事宜：详实子样本打算规范，请连续线下人工服务。

生物信息学分析内容

10x CytAssist

10x Visium CytAssist技术工艺策划设计方案一进入退出就受到引人瞩目，不单单漂亮彻底解决了傳統策划设计方案在FFPE子样表的疼点，如果对子样表的要求更低，以优秀的信息成绩受到青睐。Visium CytAssist实验英文方案中，切开、企业准备、染色法和三维成像还在条件的载玻片勤奋努力行，在探头混种杂交种后，将多张条件的载玻片和1张中含两只驯服区城的遗传表观遗传抒发玻片植入CytAssist定性分析测量设备中，定性分析测量设备拾取明场画像，为信息定性分析出具的空间准确定位，很快将转录组探头与遗传表观遗传抒发玻片混种杂交种，最后一个，把遗传表观遗传抒发电子器件从定性分析测量设备中拿出来，对其进行后面探头扩宽及文库整合。

10x Visium HD

与规范标准规定Visium已经各个，相对于规范标准规定Visium的55 μm 点阵、六角摆放的4g手机信号点，HD则运用了2 μm的方形的陆续网格简单图案，双方直接还没有厚度，大大大大增强了4g手机信号密度计算公式，需要确保单血生殖细胞的判断率。Visium HD才能将全转录组区域人类基因表达出来的技能与单血生殖细胞判断率紧密结合实际，以革命者性的判断率和数值的品质探求FFPE团队模板中纳米级的有趣生物体学形态。

单细胞分辨率：改变了大直径55um Spot的设计，以2*2μm的方格为检测单位，以单细胞分辨率对组织进行生物学分析。
连续的组织覆盖：实现组织样本的连续检测，探索整张组织切片中以往被隐藏的生物学信息。
高质量的空间数据：借助CytAssist平台能够绘制最小生物结构和最复杂细胞微环境的空间结构图谱。