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蛋白组学

标上球蛋白组TMT

TMT(Tandem Mass Tag)高新技术设备由加拿大Thermo Fisher Scientific的开发的另一种多肽身体之外标出高新技术设备。该高新技术设备所采用了6标(TMTsixplex™ Isobaric Label Reagent Set)、10标(TMT10plex™ Isobaric Label Reagent Set )、16标(TMTpro 16plex)、18标(TMTpro 18plex)等一起位素标价签,借助与肽段特异碳水化合物位点连接起来达成与众有所不同因素的肽段标出,第二去串联和并联质谱酶联免疫法分析,监测系统碎裂之后的标价签达成肽段酶联免疫法。做次科学试验可利索比最小18种与众有所不同模本中蛋白酶质的比较水平。

TMT微生物培养基其主要由3这部分构成的:统计基团、发展基团和肽发生反应基团。以6标微生物培养基为例子:统计基团比较原子核服务服务的质量区分为126、127、128、129、130和131;发展基团比较原子核服务服务的质量区分为103、102、101、100、99和98,是这样就构成了6种比较原子核服务服务的质量均为229的等量异位标示。统计铁离子的程度就意味着了响应图纸中淀粉酶质/肽段的程度,达成了对差异样版中淀粉酶质的降钙素原检测浅析和降钙素原检测浅析。
 
技术优势

1. 灵敏度高:低丰度蛋白也能检测出
2. 适用范围广:几乎可对任何物种的各类蛋白质进行分离鉴定
3. 高通量:能同时对18组样本中包含的蛋白进行鉴定及表达差异分析
4. 高效:液相色谱与串联质谱连用,自动化操作,分析速度快,分离效果好

 
样本起始量与送样建议

样本类型 起始量
宠物及临床实践脏器公司安排/脑公司安排等 >20mg
动物界及临床药理皮肤图片/骨/静脉/脂肪多组织机构等 >100mg
花草嫩叶阻止/花 >200mg
蕨类植物根/茎/根茎/种子视频下载 >500mg
原代体上皮细胞/体上皮细胞系 >5×106
总RNA >100μg
 
准备工作须知:简要样版准备工作指引,请找话题手机在线网上客服。
 
生物信息学分析内容



项目文章

Luo Z, Peng W, Xu Y, Xie Y, Liu Y, Lu H, Cao Y, Hu J. Exosomal OTULIN from M2 macrophages promotes the recovery of spinal cord injuries via stimulating Wnt/β-catenin pathway-mediated vascular regeneration. Acta Biomater. 2021 Dec;136:519-532. PMID: 34551329.

常见问题
 
1. iTRAQ及TMT等标志定量分析蛋白酶质组技艺有怎样的性能?

iTRAQ以及TMT等标记定量蛋白质组技术分辨率高,细胞样品最多可鉴定超过6000个蛋白,并且绝大多数蛋白都有定量和定性信息;其次是通量高,可以一次最多完成8个(iTRAQ)或者10个(TMT)样品的实验,特别适合于多组样品间的同时比较以及生物学过程的动态检测。

2. 也没有全基因遗传组统计数据的动物群该是如何完成球蛋白的评定?

对于已经公布全基因组序列的物种,可以在得到全序列后构建本地建库并进行本地检索;对于未进行全基因组测序的物种,可以采用近缘物种的数据库或者EST数据以及转录组数据进行检索。

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