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空间转录组测序

10x Visium

10x Genomics Visium将什么是人类基因地方表示web3d,在辨别其他神经肿瘤细胞群的此外保存地方原型,提供了了了关羽组织开展开展微环镜中神经肿瘤细胞效果、表型和区域关联的关键所在的信息,为什么是人类基因表示和组织开展开展非常矛盾性深入分析提供了了了一大个新的视野。

将急冻公司切块放到在10X Genomics Visium集成电路集成块的的抓取板块内,做好HE印染和影像后,对公司切块做好透化操作,神经元内的mRNA挥发释放,可以被集成电路集成块上配有oligo-dT的电极抓取,其次一个电极都配有特异的地扯回文序列,其次以mRNA为模本做好cDNA制成,整合文库后做好测序,可以就能拥有基因遗传体现的区域个人信息。
 
Visium空间区域基因组表达出来玻片新信息

Visium处理器有4个截获区域中内,一个区域中内规格为6.5mm *6.5mm,一个spot直徑为55um,一般包括百余万个用到截获的oligo电极字段,紧邻三个spot点的咨询中心远距离为100um。电极字段的构成为:测序引物整合字段,16 nt spatial barcoded,12 nt UMI及30 nt oligo-dT字段。
 
 
样本起始量与送样建议

组织类型 样本收集
OCT包埋冻成组织性/白片/切成片 制备 OCT包埋冰冻组织块,建议组织大小为长×宽不超过 6.5mm×6.5mm,高度≥5mm;
白片或贴片建议准备6-13 片(10μm 厚度)。
封装好用干冰进行寄送。
FFPE包埋企业/白片/组织切片 石蜡包埋组织封装好后,4℃进行寄送。
石蜡包埋白片或贴片建议准备6-13 片(5μm 厚度),4℃进行寄送。
 
特别注意事情:仔细样表的准备指导书,请联系起来同屏在线售后。
 
生物信息学分析内容

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