【两组学共同】本文带您熟知转录组/球蛋白组+分解组在分子生物学调查中的共同定性分析营销策略

由于疾病的发病机理及病程发展极其复杂，基因变异、表观遗传的改变、基因表达水平、翻译后修饰、代谢结构等的异常，等诸多因素都在影响着生命体特征的改变。单一组学的研究只能识别单一的变化，不能发现导致变化的原因，也无法研究复杂生物过程的相互联系。而不同组学的联合分析，不仅可以相互验证，而且可以系统全面地解析分子功能和调控机制，用于多层次、多角度地解析致病机理及寻找治疗靶点。

基于此，接下来分享三篇医学领域的转录组/蛋白组+代谢组研究案例，带您一览组学联合的常见分析策略~

【探析案例分享1】 链表探析---探析阐释阿尔茨海默病的重大疾病突破和异质性
 

题目：Unified epigenomic, transcriptomic, proteomic, and metabolomic taxonomy of Alzheimer’s disease progression and heterogeneity

期刊：SCIENCE ADVANCES

影响因子：13.6/Q1

组学技术：表观组、转录组、蛋白组、代谢组

 

研究背景

 

该设计了解了822例去逝脑团队和1041例血液循环系统范例的DNA 甲基化、RNA seq、蛋清质组、消化吸收组和感觉运动神经病理学数据源，应该用打了个种大气的交差核验机设备学习知识聚类算法解释了迟发性 AD 中感觉运动神经退行性新况和异质性后面的多形式大分子相空间。

 

水平路线地图

 

毕竟风采展示
 

 

 

调查报告的格式

 

 

1）对脑组织的多组学数据采用了一种新颖的交叉验证机器学习算法，将其分为3个疾病亚型（ROSMAP）：AD sub1、 AD sub2、 AD sub3；

2）发现代谢（胰岛素、瘦素等蛋白；基因HMG20A）、免疫浸润（蛋白MCP2）、免疫反应（蛋白PARC）、抗氧化信号（基因KIAA0319和代谢物a-tocopherol）、蛋白裂解（代谢物asparagine）等这些生物学过程中的作用因子在AD进展中发挥着关键作用；

3）分析脑组织和血液样本的组学相似性，发现了跨组织的信号通路，如白介素信号转导通路、CCKR通路和WNT通路等。

 

【分析案列2】 逻辑分析---阐释小胶质组织激光能量紧缺多阿尔茨海默病危险因素的用途研究进展
 

 

 

题目：TREM2 Maintains Microglial Metabolic Fitness in Alzheimer’s Disease

期刊：cell

影响因子：64.5 /Q1

组学技术：转录组、代谢组

 

研发背景图案

 

在小鼠中灵魂存在TREM2DNA的发生高投资风险突变率会使得小胶质生殖中枢神经系统元没有正热量。当小胶质生殖中枢神经系统元没有正热量时，二者不也能抑制中枢神经系统元出现威害的斑块。深入分析证明给头脑中的消除精兵（即小胶质生殖中枢神经系统元客户群体）出具正热量，几率会减少中枢神经系统损害和抑制AD患儿亲身经历的记忆法缺失和自觉性失衡。

工艺自驾路线
 

 

 

的结果显示
 

 

 

调查理论依据

 

1）TREM2基因发生高风险突变会导致清除大脑中碎片的小胶质细胞缺乏能量，当小胶质细胞缺乏能量时，它们不能够阻止神经元产生有害的斑块；

2）正常的小胶质细胞包围着这些Aβ斑块，阻止受损区域增加。缺乏TREM2的小鼠的小胶质细胞允许这些斑块扩散，从而更加广泛地破坏神经元；

 3）给缺乏TREM2的小鼠喂食环肌酸（cyclocreatine），可诱导小胶质细胞包围有害斑块，进而使神经元损伤显著减少。

 

【科研例3】 组学阐述---体现阿尔茨海默病病理报告成长 进程中的身份证性别区别

题目：Insulin and serine metabolism as sex-specific hallmarks of Alzheimer’s disease in the human hippocampus

期刊：Cell Reports

影响因子：9.8 /Q1

组学技术：蛋白组、代谢组
 

研究背景

阿尔茨海默病是一个种感觉神经退行性慢性病，加重危害着猿类身心健康，单双眼皮与AD发作的风险频繁关于，妈妈AD发作率相关系数多于同龄异性。该实验只依靠蛋白质组和消化吸收组来探讨AD病理学有中的单双眼皮一定的差异。
 

技术设备的路线
 

 

 

结果展示

 

 

研发理论依据

1）通过蛋白组和代谢组在人海马组织中发现了性别特异的AD靶标；

2）在女性海马组织中，D-Ser/total Ser 比率显著增加，且胰岛素信号通路激活表达；

3）AD患者中D-Asp 和 L-Asp等蛋白变化与性别无显著关联关系。
 

合作数据分析政策工作小结

转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括：

（1）代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析，从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响；

（2）转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析，从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性，从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用；

（3）分析不同作用因子（如基因、蛋白、代谢物）在某一特定代谢通路中的上下游调控关系，揭示该代谢通路在疾病进程中的调控作用，从而锁定与疾病显著相关的代谢过程。

（4）多因子（如基因、蛋白、代谢物）的分子靶标筛选，多层次、多角度地解析致病机理及寻找治疗靶点。